(一)治療
沙眼衣原體肺部感染的治療主要為紅霉素或四環(huán)素(不用于孕婦和兒童)類口服，新生兒和嬰兒的用量為紅霉素每天40mg/kg，或琥乙紅霉素每天40mg/kg，亦可用磺胺異噁唑(磺胺二甲基異噁唑)每天100mg/kg，療程2～3周。成人紅霉素或四環(huán)素口服的用量為2g/d，療程2周;亦可用阿莫西林(500mg/次，2次/d)、多西環(huán)素(100mg/次，2次/d)治療，療程1～2周;或用氧氟沙星300mg/次,2次/d，療程1周。對輕癥感染，阿奇霉素1g頓服亦有效。
(二)預后
沙眼衣原體感染大多形成瘢痕，也可出現(xiàn)倒睫、瞼內翻、角膜潰瘍等。沙眼衣原體肺炎不經治療一般在數(shù)周后也可逐漸自愈。