沙眼衣原體新生兒肺炎主要見于2～12周新生兒及嬰兒，大多數(shù)無發(fā)熱，起始癥狀通常是鼻炎、伴鼻腔黏液性分泌物和鼻塞。隨后發(fā)展為斷續(xù)的咳嗽，呼吸急促，可聞及肺部啰音，可伴有心肌炎和胸腔積液。半數(shù)患兒可伴有急性包涵體性結膜炎。成人免疫抑制患者可見咽炎、支氣管炎和肺炎等呼吸道感染，可有干咳、發(fā)熱、肌痛、寒戰(zhàn)、咯血和胸痛。肺部X線顯示為間質浸潤，亦可見支氣管肺炎或網(wǎng)狀、結節(jié)樣陰影。
沙眼衣原體肺部感染的臨床癥狀及X線表現(xiàn)均無特異性，故確診有賴于實驗室診斷。
1.最可靠的方法是進行沙眼衣原體的培養(yǎng)，取鼻咽部或咽后壁拭子、氣管和支氣管吸出物、肺泡灌洗液等標本培養(yǎng)，新生兒沙眼衣原體肺炎可同時取眼結膜刮屑物培養(yǎng)和(或)涂片直接熒光法(DFA)檢測沙眼衣原體。分離物可用沙眼衣原體種特異性單克隆抗體進行鑒定。
2.應用PCR試驗對上述標本進行檢測對診斷有很大幫助，但需要注意質量控制，防止出現(xiàn)假陽性結果。
3.微量免疫熒光試驗(MIF)是目前國際上標準的且是最常用的沙眼衣原體血清學診斷方法，尤其適用于新生兒和嬰兒沙眼衣原體肺炎的診斷，因為可檢測出患兒血清中存在高水平的非母體IgM抗體(不通過胎盤屏障)。血清學診斷標準為：MIF試驗IgG≥1∶512和(或)IgM≥1∶32，在排除類風濕因子(RF)所致的假陽性后可診斷為近期感染，雙份血清抗體滴度4倍或以上升高也診斷為近期感染。

本病應注意與病毒性肺炎或支原體肺炎相鑒別。