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Science癌癥特刊:針對(duì)RAS基因的靶向藥物研發(fā)盤點(diǎn)

摘要:癌細(xì)胞的一大特點(diǎn)是其新陳代謝與正常細(xì)胞有很大的區(qū)別,因?yàn)榘┘?xì)胞需要大量的營養(yǎng)和能量來支持其快速的生長(zhǎng)過程。

  RAS是第一個(gè)在人類腫瘤中被鑒定出來的致癌基因,時(shí)至今日,三個(gè)RAS基因也是在癌癥中最常見的致癌基因——大約25%的人類腫瘤里存在RAS突變。科學(xué)家們?cè)缇桶l(fā)現(xiàn),RAS基因突變會(huì)導(dǎo)致它持續(xù)的過度活躍,從而促使癌細(xì)胞生長(zhǎng)。再加上RAS突變的廣泛存在,它實(shí)在是一個(gè)理論上理想的藥物靶點(diǎn)。但是,自RAS蛋白被發(fā)現(xiàn)30多年以來,還沒有一個(gè)針對(duì)RAS的藥物被成功研發(fā)出來,這也讓一些人認(rèn)為RAS是不可成藥的。不過,很多科研人員并沒有放棄,2013年美國國家癌癥研究院(NationalCancerInstitute)專門提出一項(xiàng)倡議,對(duì)RAS“宣戰(zhàn)”。最近幾年對(duì)于RAS本身和RAS靶向藥物研究取得了很大的進(jìn)展。

  腫瘤中的RAS突變

  目前已知的RAS家族共有三個(gè)基因:KRAS,NRAS和HRAS。在人類腫瘤中,KRAS突變是最為常見的,約占85%,NRAS和HRAS分別占12%和3%。在美國,死亡率最高的三種癌癥(胰腺癌、結(jié)直腸癌和肺癌)也恰好是RAS突變最多見的三種癌癥,分別占這三種癌癥患者數(shù)的95%、52%和31%。而在乳腺癌、卵巢癌和腦癌中,RAS的突變非常少見。在胰腺癌、結(jié)直腸癌和肺癌中,KRAS突變占絕對(duì)多數(shù)。NRAS突變多見于黑色素瘤和急性骨髓性白血病,HRAS突變多見于膀胱癌和頭頸癌。不過,為什么KRAS突變最常見,以及為何不同腫瘤中RAS突變發(fā)生幾率不一樣,目前還沒有一個(gè)很好的解釋。

  過去RAS藥物研發(fā)過程的經(jīng)歷

  三個(gè)RAS基因編碼了4個(gè)非常相似的蛋白質(zhì):KRAS4A、KRAS4B、HRAS和NRAS,它們都是三磷酸鳥苷水解酶(GTPases)。RAS基因的突變會(huì)導(dǎo)致其編碼的GTPases處于持續(xù)活躍狀態(tài),激活下游信號(hào)通路,促進(jìn)癌細(xì)胞生長(zhǎng)。

  最早的RAS藥物研發(fā)想法是尋找GTP的類似物以抑制RAS的活性,不過,由于RAS對(duì)于GTP的親和度高達(dá)皮摩級(jí),而細(xì)胞內(nèi)的GTP濃度要高得多,因此這一想法一直沒有取得成功。此外,由于對(duì)RAS與GTP結(jié)合的活性位點(diǎn)的結(jié)構(gòu)缺乏足夠了解,尋找能直接抑制活性部位的藥物的努力也失敗了。研究人員也嘗試過減少RAS與細(xì)胞膜的結(jié)合以抑制其活性。但是,由于當(dāng)時(shí)誤以為4個(gè)RAS的功能完全一致,在體外研究中對(duì)于HRAS有效的藥物,在針對(duì)KRAS占主導(dǎo)地位的癌癥的臨床試驗(yàn)中也遭到了失敗。

  近年來,由于對(duì)于這四個(gè)RAS蛋白功能和信號(hào)調(diào)控的進(jìn)一步認(rèn)識(shí),在吸取了以前失敗經(jīng)驗(yàn)的基礎(chǔ)上,藥物研究又重新活躍了起來。

  抑制RAS與細(xì)胞膜的結(jié)合

  研究發(fā)現(xiàn),RAS的致癌功能與其在細(xì)胞內(nèi)的位置有很大關(guān)系,當(dāng)RAS位于細(xì)胞膜的內(nèi)表面時(shí)活性最強(qiáng)。最近的研究還發(fā)現(xiàn)了對(duì)RAS蛋白翻譯后的修飾控制了其在細(xì)胞內(nèi)的位置。在RAS轉(zhuǎn)移去細(xì)胞膜的過程中的第一步是由法呢基轉(zhuǎn)移酶(farnesyltransferase)在RAS的C端加上一個(gè)法呢基。因此,在90年代時(shí),抑制法呢基轉(zhuǎn)移酶的活性是RAS藥物研發(fā)中的重點(diǎn),不過其中至少兩個(gè)藥物都在3期臨床中失敗了。后來發(fā)現(xiàn),4個(gè)RAS蛋白中最常見的KRAS4B可以得到一個(gè)與法呢基結(jié)構(gòu)類似的香葉基香葉基異戊二烯(geranylgeranylisoprenoid)來完成向細(xì)胞膜的轉(zhuǎn)移。最近,通過篩選可以直接抑制RAS與細(xì)胞膜結(jié)合的小分子,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)潛在的藥物fendiline,它可以選擇性地減少KRAS4B與細(xì)胞膜的結(jié)合。

  最近的研究中發(fā)現(xiàn)的這一通路中另一個(gè)潛在的靶點(diǎn)是磷酸二酯酶δ(PDEδ)。PDEδ可以結(jié)合RAS蛋白上的法呢基,并將RAS送往高爾基體,隨后在通過囊泡運(yùn)輸前往細(xì)胞膜。研究發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)小分子藥物deltarasin和deltazinone可以抑制PDEδ與法呢基的結(jié)合。在小鼠腫瘤模型中的實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),這兩個(gè)藥物可以將RAS滯留在細(xì)胞內(nèi)部從而抑制腫瘤生長(zhǎng)。不過這兩個(gè)藥物對(duì)于RAS不是特異性的,它們有可能影響其它帶有法呢基的蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn),因此其安全性還有待驗(yàn)證。

  抑制RAS的下游信號(hào)通路

  抑制RAS下游的信號(hào)蛋白是目前吸引了最多注意力的針對(duì)RAS的藥物研發(fā)策略。不過,RAS下游已知有至少11個(gè)不同蛋白家族參與其信號(hào)傳遞,針對(duì)哪個(gè)或者哪幾個(gè)家族能產(chǎn)生抗癌效果是一個(gè)關(guān)鍵問題。目前研究最集中的是兩個(gè)信號(hào)通路:RAF-MEK-ERK和PI3K-AKT-mTOR。因?yàn)檫@兩個(gè)通路中都被發(fā)現(xiàn)有致癌的基因突變,包括BRAF和PIK3CA。目前的研究結(jié)果顯示,似乎RAF-MEK-ERK通路在癌癥中更重要一些。因?yàn)樵跊]有KRAS突變的少量胰腺癌中,一大部分帶有BRAF突變。在小鼠中的研究顯示,如果RAS的功能缺失,RAF-MEK-ERK信號(hào)通路中的成員能夠彌補(bǔ)這一小點(diǎn)。

  在RAF-MEK-ERK通路中,第一個(gè)被RAS激活的成員是RAF激酶,包括ARAF、BRAF和CRAF。其中,BRAF抑制劑vemurafenib和dabrafenib已經(jīng)獲批用于治療攜帶BRAF突變的黑色素瘤。但是,這兩個(gè)藥物在攜帶RAS突變的腫瘤中不起作用。主要原因是RAS突變能夠?qū)е翨RAF和CRAF的二聚物形成,抑制BRAF反而能夠激活CRAF,從而使BRAF抑制劑失去抗癌作用。目前有企業(yè)正在研究第二代的泛RAF抑制劑,包括LY3009120和PLX8394,它們能夠有效抑制下游的MEK和ERK活性。

  MEK的選擇性抑制劑,包括trametinib和cobimetinib也已經(jīng)獲批用于治療攜帶BRAF突變的黑色素瘤。不過令人遺憾的是,它們對(duì)于RAS突變的腫瘤同樣不起作用。因?yàn)樵赗AF-MEK的信號(hào)傳導(dǎo)過程中有一個(gè)反饋機(jī)制,當(dāng)MEK被抑制后,細(xì)胞能夠加強(qiáng)RAF的活性,直到能夠克服對(duì)于MEK的抑制。于是,對(duì)于RAS突變的藥物研發(fā)將目光轉(zhuǎn)向了更下游的ERK激酶,目前有多個(gè)ERK抑制劑在臨床試驗(yàn)中。

  PI3K-AKT-mTOR通路在腫瘤生長(zhǎng)的過程中的作用也許是小了一些,但是它對(duì)于RAF-MEK-ERK通路有重要的補(bǔ)充作用。對(duì)于RAF-MEK-ERK抑制劑的抗藥性有很大程度就來自于PI3K-AKT-mTOR通路的激活。多個(gè)藥物聯(lián)用來同時(shí)抑制這兩個(gè)通路在小鼠實(shí)驗(yàn)中取得了很好的抗癌效果。但是,在人的臨床試驗(yàn)中,同時(shí)抑制兩個(gè)信號(hào)通路帶來了許多副作用。目前正在研究如何協(xié)調(diào)對(duì)這兩個(gè)通路的抑制來降低毒性。

  RAS突變的合成致死相互作用

  合成致死的概念也被應(yīng)用到了針對(duì)RAS的藥物研發(fā)中。合成致死是指通過大規(guī)模篩選尋找那些對(duì)于RAS突變的細(xì)胞而不是RAS正常的細(xì)胞的存活起關(guān)鍵作用的基因,當(dāng)抑制那些基因時(shí),與RAS突變產(chǎn)生了合成致死相互作用,對(duì)正常細(xì)胞沒有影響。2009年時(shí),有研究團(tuán)隊(duì)報(bào)道了STK33和TBK1等幾個(gè)激酶與RAS突變有合成致死相互作用,但是進(jìn)一步的研究沒有能夠證實(shí)這些作用。傳統(tǒng)上的基于RNAi的合成致死基因篩選存在著特異性不高等缺陷是導(dǎo)致這一結(jié)果的可能原因。

  最近,一些科研人員開始采用特異性更好效率更高的CRISPR技術(shù)開始尋找RAS突變的合成致死基因,并取得了一些進(jìn)展。被發(fā)現(xiàn)的基因包括與RAS和細(xì)胞膜結(jié)合有關(guān)的RCE1和ICMT,以及能夠調(diào)控ERK-MAPK信號(hào)傳導(dǎo)的RAF1,SHOC2和PREX1等。不過,由于每個(gè)攜帶RAS突變的腫瘤都可能存在許多其它突變,這些合成致死基因能有多大的效果還需更多研究。

  抑制RAS調(diào)控的新陳代謝過程

  癌細(xì)胞的一大特點(diǎn)是其新陳代謝與正常細(xì)胞有很大的區(qū)別,因?yàn)榘┘?xì)胞需要大量的營養(yǎng)和能量來支持其快速的生長(zhǎng)過程。最近的一些研究顯示RAS突變調(diào)控了其中一些過程,如果能夠抑制這些過程,也有望抑制RAS突變腫瘤的生長(zhǎng)。

  RAS突變能夠激活巨胞飲作用,它是細(xì)胞內(nèi)吞作用的一種,可以從細(xì)胞外獲取營養(yǎng)物質(zhì)和水。現(xiàn)在并沒有能夠直接抑制巨胞飲作用的藥物,但是,有一個(gè)鈉離子/氫離子交換通道的抑制劑EIPA能夠間接抑制巨胞飲作用,有證據(jù)顯示它能夠減緩胰腺癌的生長(zhǎng)。另外,巨胞飲作用獲取的營養(yǎng)成分中很重要的一種是白蛋白,它可以作為氨基酸的來源。如果使用一些能夠與白蛋白特異結(jié)合的,攜帶化療藥物紫杉醇的納米顆粒,可以將紫杉醇直接送入癌細(xì)胞內(nèi),也許能取得一定的抗癌效果。

  RAS突變的癌細(xì)胞獲取營養(yǎng)的另一種方法是自噬作用,細(xì)胞可以通過它來降解細(xì)胞內(nèi)不需要的細(xì)胞器來獲取生長(zhǎng)所必需的氨基酸、脂質(zhì)和核酸等。氯喹類的抗瘧藥對(duì)于自噬作用有抑制效果,并且對(duì)于巨胞飲作用也有一定的抑制效果。氯喹在一個(gè)小鼠胰腺癌模型中取得了不錯(cuò)的效果。目前有一項(xiàng)臨床試驗(yàn)正在評(píng)估羥氯喹在胰腺癌中的潛在療效。

  最后,攜帶RAS突變的胰腺癌細(xì)胞被發(fā)現(xiàn)更依賴于從谷氨酰胺來產(chǎn)生NADPH,NADPH對(duì)于維持細(xì)胞內(nèi)的氧化還原平衡起關(guān)鍵作用。正常細(xì)胞主要從葡萄糖產(chǎn)生NADPH,因此,抑制從谷氨酰胺產(chǎn)生NADPH的化學(xué)過程能夠特異針對(duì)癌細(xì)胞。目前,有一個(gè)抑制這個(gè)過程中的第一步谷氨酰胺酶的小分子藥物CB-839正在臨床試驗(yàn)中,用于評(píng)估其對(duì)白血病和多種腫瘤的效果。抑制這個(gè)過程中的其它參與者的藥物也有多個(gè)在臨床前研究中。

  直接抑制RAS的活性

  當(dāng)1989年HRAS的晶體結(jié)構(gòu)首先被報(bào)導(dǎo)時(shí),科研人員發(fā)現(xiàn)在它的表面沒有一個(gè)明顯的結(jié)合GTP的“口袋”,這讓那些想要直接抑制RAS活性的人感到無從下手。近來,通過大規(guī)模的化合物篩選,發(fā)現(xiàn)了一些有望直接對(duì)RAS產(chǎn)生作用的化合物。其中一些能夠抑制RAS與SOS1的結(jié)合,這能夠有效減慢RAS獲得GTP的速度,另一些能夠抑制RAS與下游信號(hào)蛋白如RAF的結(jié)合。不過,這些化合物與RAS的親和性都較低,要在人體內(nèi)產(chǎn)生效果,還需要更高親和性的化合物。

  另一些研究人員發(fā)現(xiàn)了一類能夠抑制KRAS的一個(gè)特定突變G12C的化合物。盡管G12C只占所有KRAS突變的12%,它在肺癌中卻占大多數(shù)。這類化合物能共價(jià)結(jié)合帶G12C突變的KRAS,并將其鎖在非激活狀態(tài)。這其中的一個(gè)化合物ARS-853在體外實(shí)驗(yàn)中能夠抑制肺癌細(xì)胞的生長(zhǎng)。研究還發(fā)現(xiàn),G12C這個(gè)突變和其它突變不同,帶G12C的KRAS的激活過程還與EGFR有關(guān)。因此,同時(shí)抑制EGFR和帶G12C的KRAS在理論上能在肺癌中產(chǎn)生更好的療效。這項(xiàng)研究說明了KRAS的不同突變的致癌機(jī)制不盡相同,因此,尋找針對(duì)特定突變的藥物將是下一個(gè)研究方向之一。

  總結(jié)和展望

  盡管過去二三十年來對(duì)于RAS的藥物研發(fā)過程非常曲折,但是整個(gè)領(lǐng)域仍然對(duì)前景感到樂觀,針對(duì)RAS的藥物在不久的將來應(yīng)該就會(huì)出現(xiàn)。不過我們對(duì)于RAS的功能以及RAS突變致癌的機(jī)理仍然沒有完全清楚,這意味著在這個(gè)領(lǐng)域仍然很有可能出現(xiàn)更多失敗的例子。

  有一點(diǎn)可以肯定的是,針對(duì)RAS的藥物將不可避免地向個(gè)體化發(fā)展,出現(xiàn)一個(gè)對(duì)所有RAS突變都有效的藥物幾乎是不可能的。針對(duì)不同腫瘤中的不同RAS蛋白,甚至不同的RAS突變,都將會(huì)有不同的藥物。

  隨著越來越多的科學(xué)家加入RAS研究的領(lǐng)域,藥物研發(fā)的過程也將會(huì)被加快。從目前來看,針對(duì)RAS下游信號(hào)通路的抑制劑有望最早獲得成功,因?yàn)檫@一部分已經(jīng)有多個(gè)藥物進(jìn)入了臨床試驗(yàn)。從長(zhǎng)遠(yuǎn)來看,直接抑制RAS的藥物很有可能是最有效的。隨著癌癥免疫療法的迅速發(fā)展,RAS和腫瘤免疫之間的關(guān)系會(huì)將是一個(gè)研究熱點(diǎn)。此外,通過RNAi或CRISPR技術(shù)直接抑制RAS突變基因的表達(dá)也有很大的潛力。

  總的來說,盡管仍有許多的障礙,我們對(duì)于最終戰(zhàn)勝RAS突變依然充滿了信心。

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