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江蘇疾控部門發(fā)現(xiàn)新型環(huán)狀單鏈DNA病毒

2018-07-20 來(lái)源:中國(guó)病毒學(xué)論壇  標(biāo)簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護(hù)膚
摘要:據(jù)介紹,該病毒基因組含2種主要開(kāi)放讀碼框(ORFs),分別編碼復(fù)制酶蛋白R(shí)ep和衣殼蛋白Cap;有2個(gè)基因間隔區(qū),其中大的間隔區(qū)含有環(huán)狀病毒特征性莖環(huán)結(jié)構(gòu)。

 16日,記者從江蘇省疾控中心獲悉,該中心從一例新加坡回國(guó)發(fā)熱病人送檢樣本中,首次鑒定出一種新型環(huán)狀單鏈DNA病毒。

 
根據(jù)該中心公布信息:此次新發(fā)現(xiàn)病毒是該中心病原所對(duì)今年9月27日江蘇出入境檢驗(yàn)檢疫局送檢的一例從新加坡回國(guó)的發(fā)熱病人咽拭子樣本進(jìn)行病原體檢測(cè)后所得。病原所實(shí)驗(yàn)室人員通過(guò)對(duì)送檢樣本用高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)其中含有一種新型環(huán)狀單鏈DNA病毒片段,后根據(jù)高通量測(cè)序reads序列設(shè)計(jì)特異引物,對(duì)病人咽拭子樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)過(guò)sanger測(cè)序、序列組裝,于10月26日獲得該病毒全長(zhǎng)基因序列3018nt。
 
據(jù)介紹,該病毒基因組含2種主要開(kāi)放讀碼框(ORFs),分別編碼復(fù)制酶蛋白R(shí)ep和衣殼蛋白Cap;有2個(gè)基因間隔區(qū),其中大的間隔區(qū)含有環(huán)狀病毒特征性莖環(huán)結(jié)構(gòu)。與該病毒最相似的為豬糞相關(guān)的環(huán)狀病毒5(porcinestool-associatedcircularvirus5(PoSCV5),isolateCP3),編碼蛋白氨基酸序列相似性約為43%和50%,進(jìn)化分析揭示這2種編碼蛋白分別與環(huán)狀病毒科及未分類的環(huán)狀單鏈DNA病毒聚為一類,疑似為一種新型病毒。
 
目前,該中心初步將該病毒命名為HumanPoSCV5-likecircularvirus(isolateMRJ),基因組序列已遞交GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)(Accessionno.KY052047)。
 
根據(jù)實(shí)驗(yàn)室分析,在對(duì)病人的尿、血和唾液樣本進(jìn)一步檢測(cè)中發(fā)現(xiàn),唾液中可以檢測(cè)出該病毒,而尿和血液中檢測(cè)不到。
 
此前發(fā)現(xiàn)的豬糞相關(guān)的環(huán)狀病毒可引起豬腹瀉,人未見(jiàn)感染報(bào)道。其他種屬的環(huán)狀單鏈DNA病毒有在多發(fā)性硬化癥病人的腦積液和血清、心包炎病人的心包液及腦炎病人的腦積液檢測(cè)出的報(bào)道,但是與疾病的聯(lián)系均不能確立。所以,目前該新型環(huán)狀單鏈DNA病毒與病例所患疾病的關(guān)聯(lián)還不明確。
 
目前,實(shí)驗(yàn)室正對(duì)樣本進(jìn)行病毒分離培養(yǎng),以便開(kāi)展下一步的研究工作。
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